Viva el Software Libre

Insertar referencias bibliográficas en R Markdown desde Zotero con citr

Para los que usamos regularmente RStudio y R Markdown en ambientes científicos, nos es imprescindible incorporar referencias bibliográficas en nuestros textos. En mi caso, mi gestor de referencias bibliográficas es Zotero, uno de los que yo considero mejores gestores del mundo, y que además también es software libre, como no podría ser de otro modo. Después de buscar un rato por internet,…

Calcular el tiempo de ejecución de un código de R

Puede resultar insignificante, principalmente a las personas que hacen un uso moderado de R, pero en un mundo de constante optimización, el tiempo lo es todo. Y no es lo mismo que un código tarde en ejecutarse 10 minutos que 30 minutos. Así visto, cualquiera puede apreciar que no hay tanta diferencia. Sin embargo, si una tarea en R se hace en 2 días de ejecución del código, ¿a que no es lo mismo…

Cómo modificar las funciones incluidas en paquetes de R

Os voy a contar un caso real, un caso que me sucedió a mí y ahora comparto con todos vosotros. Estaba realizando varios biplots de análisis de componentes principales en R, utilizando el paquete ggbiplot. Para ello utilicé la función homónima al paquete para crear esos fantásticos gráficos usando de base ggplot2. El caso era que tenía que hacer una malla de 16 biplots, en 4 filas y 4 columnas. Si…

Mapas de Leaflet en los PDF exportados desde R Markdown

Durante la escritura de mi tesis doctoral, que estoy haciendo en R Markdown, me he visto en la necesidad de poner algunos mapas entre el contenido del texto. Como bien sabréis, los archivos de R Markdown pueden exportarse a varios formatos. Y entre estos formatos se encuentra la conversión a PDF. Pues bien, en vez de  obtener una imagen del mapa en cuestión e incorporarla posteriormente al…

Elimina archivos duplicados en Linux de un modo rápido y sencillo

¿Cuántas veces nos ha pasado que tenemos varias copias de seguridad de fotos y vídeos, con versión 1, versión 2 etc? Sobre todo con el tema de las imágenes, este hecho es más acuciante. Que si las fotos del último viaje a Filipinas, que si las fotos de la boda del año pasado donde nos lo pasamos tan bien… que las metemos en varias carpetas, las reorganizamos varias veces… copiamos y pegamos a un…

Arreglar una partición unallocated con testdisk: mi experiencia de principio a fin

Esto que os voy a contar ha sido una experiencia personal con un disco duro mío. No son refritos de internet, sino simplemente mi experiencia real, y afortunadamente con un final feliz. Tengo en mi haber un disco duro externo, concretamente un Iomega eGo de 500 GB, en el que he ido haciendo mi tesis doctoral en los últimos años. Y de repente, de un día para otro, el disco duro dejó de funcionar.…

head = head(mtcars) tail = tail(mtcars)

head plot(mtcars) “`=====EndrmdSourceCode=====

Coeficiente de correlación en R

Es relativamente frecuente que haya cierta confusión en relación a lo que estudia un análisis de regresión y un análisis de correlación. Sin embargo, ambos análisis ofrecen información complementaria. El Análisis de Regresión estudia la forma en que ambas variables aleatorias están relacionadas, mientras que el Análisis de Correlacióninvestiga la fuerza de dicha relación. En esta entrada vamos a…

Crear un lanzador de R Commander en Linux

Para abrir nuestra interfaz gráfica favorita de R en Linux, tenemos que acceder a la terminal, abrir R y posteriormente llamar a la librería de R Commander, que se llama Rcmdr. Como veis, son varios pasos antes de disfrutar de ella. En esta entrada os voy a enseñar a crear un lanzador de R Commander en Linuxpara que ejecutéis R Commander haciendo doble click sobre su icono. De un modo rápido y…

Cómo decir TE QUIERO usando el código de R

Nunca es tarde para decir a esa persona cuánto la quieres. Y si además somos unos enamorados de R, podemos fardar muchísimo mostrando con el código cuánto la queremos. En esta entrada os voy a mostrar cómo decir Te quiero usando el código de R de dos formas: una forma en modo texto y otra en modo gráfico. De este modo podréis decirle a la persona que amáis que la queréis de un modo completamente…

Calcular las distancias entre todos los puntos de un diagrama en R

En ocasiones puede interesarnos calcular las distancias entre todos los puntos de un diagrama de dispersión.  Y esto en R es muy fácil hacerlo. Pero la pregunta es,  ¿cuándo nos puede interesar calcular las distancias entre todos los puntos de un diagrama de dispersión en R? Pues una de las respuestas puede ser si el diagrama de dispersión, o scatterplot, representa un área geográfica de la…

Bitcoin es una de las criptomonedas más conocidas del planeta. Hasta aquí creo que a nadie le pilla de improviso. ¿Verdad? Su valor está al alza de un modo gradual, no sin altibajos, y ha convertido a algunas personas en prácticamente multimillonarias. Pero reconozcámoslo, esos son los menos. La grandísima mayoría de la gente lo tiene como un experimento. Y yo soy uno de ellos. Empecé hace…

Intervalos de predicción de una regresión en R con ggplot2

Los intervalos de predicción son quizás algo menos conocidos que los famosos intervalos de confianza. Utilizarlos indistintamente es un error muy grave puesto que no son equivalentes y representan dos realidades muy diferentes. En esta entrada vamos a aprender a obtener intervalos de predicción de una regresión en R usando el paquete ggplot2, así como a diferenciar entre intervalos de predicción…

Listar archivos con el comando ls de Linux de un modo fácil y comprensible

De sobra es conocido que todo, absolutamente todo lo que se puede hacer con un ordenador con Linux puede hacerse desde su terminal, también conocida como consola. Hoy vamos a adentrarnos en el que es probablemente uno de los comandos más utilizados dentro de la terminal: listar archivos con el comando ls de Linux. El comando ls proviene de la palabra inglesa list, que significa algo así como…

Cambiar permisos de escritura de una partición ext4 en Linux

Pongámonos en este supuesto: tenemos varias particiones en nuestro ordenador, en las que en una de ellas tenemos instalado nuestro fabuloso sistema operativo GNU / Linux y la otra partición acabamos de formatearla con el formato ext4 para utilizarla como un disco de almacenamiento o memoria. Y la sorpresa mayúscula que nos encontramos es que no podemos copiar ni pegar nada en esa partición que…

Detectar a los cabrones que te roban la Wifi en Linux

Sí. Lo sé. El título es un poco malsonante. Pero cuando te das cuenta de que tú estás pagando religiosamente tu cuota de internet mes a mes, y ves que otros son parásitos y ladrones de tu red Wifi sin pagarte nada, te indignas… y mucho. ¿Estoy yo pagando para que un intruso te robe una parte de la Wifi que es tuya? No es justo, ¿verdad? Pues bien, en esta entrada os voy a enseñar a detectar a los…

Actualiza R en Linux con el repositorio de Ubuntu y derivados

Actualizar R en otros sistemas operativos diferentes a Linux, como Windows o Mac es relativamente sencillo. Con solo descargarse la última versión se puede estar actualizado a la última. En Linux este proceso es un poco más complejo, y de ahí el por qué de esta entrada. A continuación os mostraré de un modo sencillo cómo se actualiza R en Linux con el repositorio de Ubuntu y derivados(Linux Mint,…