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Mewからnotmuchで検索できれば最強だと思うのだけど、とりあえずnotmuch setupで~/Mailを検索できるようにした。

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とりあえずちゃんと動くバージョンができた。Traub CA3のCPU版を吐く。今日はもう限界。 変なDSL定義してパーザ書くくらいなら直接Cで書き足せばいい。

行列が決まってるなら逆行列を計算しておけばいいじゃん。

冬休みの習作として、19コンパートメントのモデル(Traub et al. 1991)をC99で実装してみた。Theoretical NeuroscienceとMethods in Neuronal Modelingは大いに参考になった。 数値計算は陰解法とstaggered time stepを試した。後者は計算精度が稼げるだけでなく、連立方程式を解くのとion channelの計算が分離できてコードが書きやすい。一通り書いて見てNEURON Bookの6章の内容がより良く理解できた。 細胞の形状や電気的性質が変化しなければ係数行列は常に一定だから、LU分解できるなあ。 前方オイラー法で解く場合のフォンノイマン安定性条件についても理解した。ちょっと手計算したらすぐわかった。モデルが決まればdtの値は具体的に決定できるのね。 それにしても、ベタに書くとすごく単純なコードになるのだな。OOなんかで書くから無駄に複雑になるのだと思う。必要なパラメータが色んなところに散らばって読みにくい＆書きにくい。

\usepackage{otf}して\CID{8443}。

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半日書いて全部的外れとかままあること。