Data-Mining Tools für PubMed
Ca. 25 Tools zur tiefergehenden Untersuchung von PubMed-Suchergebnissen werden hier gelistet, ich habe sie gerade alle kurz getestet: “PubReminer”: Die Daten von PubMed im Detail auswerten. Available at: http://www.uni-muenster.de/ZBMed/aktuelles/2953 Zugegriffen März 22, 2012. (1) und (2) sind recht ähnlich, ergänzen sich, Screenshots unten. Ich habe in PubMed die Abfrage (clinical query) zu amalgam, composite konstruiert, ergab: (Therapy/Broad[filter]) AND (amalgam composite dental) Diese Abfrage (1, 2) bzw. das Abfrageergebnis (3) wurden dann bei (1-3) einkopiert. (3) verfolgt einen etwas anderen Ansatz, weil es in den Abstracts Wortketten herausfindet und die Abstracts nach deren Häufigkeit sortiert (nachdem man eine oder mehrere der Wortketten ausgesucht hat) und ist auf den manuellen Import von 500 Abstracts limitiert. Leider habe ich bisher kein Tool gefunden, mit dem sich _neue_ Trends (neue Begriffe, Konzepte) eines medizinischen Faches in PubMed finden ließen. (4) wäre vielleicht dafür denkbar, aber ich habe dazu keine weiteren Hinweise gefunden. Falls da jemand eine Idee hätte... Vielleicht ist das für den Spezialisten, der seine speziellen Zeitschriften liest, auch ein Nicht-Problem, weil er darüber Neues mitbekommt. Für einen Generalisten wie mich wäre so ein Software-Werkzeug nützlich. 1. GoPubMed®. Available at: http://gopubmed.com/web/gopubmed/ Zugegriffen März 22, 2012. 2. PubMed PubReMiner: a tool for PubMed query building and literature mining. Available at: http://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi Zugegriffen März 22, 2012. 3. XplorMed: eXploring Medline abstracts. Available at: http://www.ogic.ca/projects/xplormed/ Zugegriffen März 22, 2012. 4. PubMed Trend Analysis using Pipeline Pilot. Available at: http://accelrys.com/resource-center/case-studies/pubmed-trend-analysis.html Zugegriffen März 19, 2012.














